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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
Data corrente: |
07/02/2019 |
Data da última atualização: |
19/12/2019 |
Autoria: |
HEBERLE, H.; MEIRELLES, G. V.; SILVA, F. R. da; TELLES, G. P.; MINGHIM, R. |
Afiliação: |
HENRY HEBERLE, ICMC/USP; GABRIELA VAZ MEIRELLES, Laboratório Nacional de Biociências, Campinas; FELIPE RODRIGUES DA SILVA, CNPTIA; GUILHERME P. TELLES, IC/Unicamp; ROSANE MINGHIM, ICMC/USP. |
Título: |
InteractiVenn: a web-based tool for theanalysis of sets through Venn diagrams. |
Ano de publicação: |
2015 |
Fonte/Imprenta: |
BMC Bioinformatics, v. 16, p. 1-7, 2015. |
DOI: |
10.1186/s12859-015-0611-3 |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
Article number: 169. |
Conteúdo: |
Abstract. Background: Set comparisons permeate a large number of data analysis workflows, in particular workflows in biological sciences. Venn diagrams are frequently employed for such analysis but current tools are limited. Results: We have developed InteractiVenn, a more flexible tool for interacting with Venn diagrams including up to six sets. It offers a clean interface for Venn diagram construction and enables analysis of set unions while preserving the shape of the diagram. Set unions are useful to reveal differences and similarities among sets and may be guided in our tool by a tree or by a list of set unions. The tool also allows obtaining subsets? elements, saving and loading sets for further analyses, and exporting the diagram in vector and image formats. InteractiVenn has been used to analyze two biological datasets, but it may serve set analysis in a broad range of domains. Conclusions: InteractiVenn allows set unions in Venn diagrams to be explored thoroughly, by consequence extending the ability to analyze combinations of sets with additional observations, yielded by novel interactions between joined sets. InteractiVenn is freely available online at: www.interactivenn.net. |
Palavras-Chave: |
Diagrama de Edwards-Venn; Diagrama de Venn; Edwards-Venn diagram; Interaction; Set-unions; Venn diagram. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/192316/1/AP-InteractiVenn-Felipe-2015.pdf
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Marc: |
LEADER 01970naa a2200265 a 4500 001 2105705 005 2019-12-19 008 2015 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1186/s12859-015-0611-3$2DOI 100 1 $aHEBERLE, H. 245 $aInteractiVenn$ba web-based tool for theanalysis of sets through Venn diagrams.$h[electronic resource] 260 $c2015 500 $aArticle number: 169. 520 $aAbstract. Background: Set comparisons permeate a large number of data analysis workflows, in particular workflows in biological sciences. Venn diagrams are frequently employed for such analysis but current tools are limited. Results: We have developed InteractiVenn, a more flexible tool for interacting with Venn diagrams including up to six sets. It offers a clean interface for Venn diagram construction and enables analysis of set unions while preserving the shape of the diagram. Set unions are useful to reveal differences and similarities among sets and may be guided in our tool by a tree or by a list of set unions. The tool also allows obtaining subsets? elements, saving and loading sets for further analyses, and exporting the diagram in vector and image formats. InteractiVenn has been used to analyze two biological datasets, but it may serve set analysis in a broad range of domains. Conclusions: InteractiVenn allows set unions in Venn diagrams to be explored thoroughly, by consequence extending the ability to analyze combinations of sets with additional observations, yielded by novel interactions between joined sets. InteractiVenn is freely available online at: www.interactivenn.net. 653 $aDiagrama de Edwards-Venn 653 $aDiagrama de Venn 653 $aEdwards-Venn diagram 653 $aInteraction 653 $aSet-unions 653 $aVenn diagram 700 1 $aMEIRELLES, G. V. 700 1 $aSILVA, F. R. da 700 1 $aTELLES, G. P. 700 1 $aMINGHIM, R. 773 $tBMC Bioinformatics$gv. 16, p. 1-7, 2015.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Solos; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
Data corrente: |
11/01/2007 |
Data da última atualização: |
11/09/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
Nacional - B |
Autoria: |
GOMES, J. B. V.; CURI, N.; SCHULZE, D. G.; MARQUES, J. J. G. de S. e M.; KER, J. C.; MOTTA, P. E. F. da. |
Afiliação: |
JOAO BOSCO VASCONCELLOS GOMES, CNPF; NILTON CURI, UFLA; DARRELL GENE SCHULZE, Purdue University; João José Granate de Sá e Melo Marques, UFLA; João Carlos Ker, UFV; PAULO EMILIO FERREIRA DA MOTTA, CNPS. |
Título: |
Mineralogia e micromorfologia de solos esqueléticos do bioma Cerrado, no leste de Goiás. |
Ano de publicação: |
2007 |
Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Ciência do Solo, Viçosa, MG, v. 31, n. 5, p. 875-886, set./out. 2007. |
DOI: |
10.1590/S0100-06832007000500005 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
A grande quantidade de material mineral com diâmetro maior que 2 mm de alguns solos do bioma Cerrado é uma característica de interesse em se tratando de formação, classificação, uso e manejo desses solos. Com o objetivo de contrastar atributos morfológicos, físicos, químicos, mineralógicos e micromorfológicos desses solos, com caráter esquelético, foram estudados perfis de Plintossolos Pétricos e Cambissolos Háplicos no leste de Goiás, comparando-os, também, com outros perfis semelhantes descritos na literatura. Cada perfil de solo (seis ao todo) correspondeu a uma trincheira, que permitiu a descrição morfológica e as amostragens, realizadas em duas profundidades, totalizando 12 amostras. Os corpos de petroplintita das frações mais grosseiras da terra fina contribuem para aumentar o Fe2O3 do ataque sulfúrico dos Plintossolos. As relações Feo/Fed são, de forma generalizada, muito baixas, refletindo a elevada estabilidade das formas cristalinas de Fe. Os Plintossolos e os Cambissolos estudados apresentam valores médios de Ki e Kr relativamente baixos quando comparados com outros solos das mesmas classes e com caráter esquelético do bioma Cerrado. A ausência de hematita na fração argila dos solos estudados reflete um processo de xantização do pedoambiente mais úmido das bordas da chapada, local de ocorrência dos Plintossolos, cujo material erodido contribui para formação dos Cambissolos. A hematita só aparece na fração areia dos Plintossolos, associada aos corpos de petroplintita. Magnetita/maghemita foram identificadas nas duas classes de solos. Nos Cambissolos, a detecção de mica por difração de raios X da fração areia e de minerais com cores de interferência fortes nas lâminas delgadas, além dos maiores valores das relações Ki e Kr, realçam a presença de material menos intemperizado, relativamente aos Plintossolos. A pequena quantidade de plasma, 10 % em relação à área das lâminas delgadas, confirma o caráter esquelético dos solos estudados. Os Plintossolos apresentam estrutura granular adensada. Os Cambissolos apresentam o espaço poroso menos conectado e dominado por alvéolos e canais, com microestrutura de grãos com películas. MenosA grande quantidade de material mineral com diâmetro maior que 2 mm de alguns solos do bioma Cerrado é uma característica de interesse em se tratando de formação, classificação, uso e manejo desses solos. Com o objetivo de contrastar atributos morfológicos, físicos, químicos, mineralógicos e micromorfológicos desses solos, com caráter esquelético, foram estudados perfis de Plintossolos Pétricos e Cambissolos Háplicos no leste de Goiás, comparando-os, também, com outros perfis semelhantes descritos na literatura. Cada perfil de solo (seis ao todo) correspondeu a uma trincheira, que permitiu a descrição morfológica e as amostragens, realizadas em duas profundidades, totalizando 12 amostras. Os corpos de petroplintita das frações mais grosseiras da terra fina contribuem para aumentar o Fe2O3 do ataque sulfúrico dos Plintossolos. As relações Feo/Fed são, de forma generalizada, muito baixas, refletindo a elevada estabilidade das formas cristalinas de Fe. Os Plintossolos e os Cambissolos estudados apresentam valores médios de Ki e Kr relativamente baixos quando comparados com outros solos das mesmas classes e com caráter esquelético do bioma Cerrado. A ausência de hematita na fração argila dos solos estudados reflete um processo de xantização do pedoambiente mais úmido das bordas da chapada, local de ocorrência dos Plintossolos, cujo material erodido contribui para formação dos Cambissolos. A hematita só aparece na fração areia dos Plintossolos, associada aos corpos de petroplinti... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Óxidos de ferro; Petroplintia; Petroplintita; Solos concrecionários; Xantização. |
Thesagro: |
Mineralogia; Oxido de Ferro; Solo. |
Categoria do assunto: |
-- P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/148429/1/a05v31n5.pdf
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Marc: |
LEADER 03120naa a2200289 a 4500 001 1339187 005 2019-09-11 008 2007 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1590/S0100-06832007000500005$2DOI 100 1 $aGOMES, J. B. V. 245 $aMineralogia e micromorfologia de solos esqueléticos do bioma Cerrado, no leste de Goiás.$h[electronic resource] 260 $c2007 520 $aA grande quantidade de material mineral com diâmetro maior que 2 mm de alguns solos do bioma Cerrado é uma característica de interesse em se tratando de formação, classificação, uso e manejo desses solos. Com o objetivo de contrastar atributos morfológicos, físicos, químicos, mineralógicos e micromorfológicos desses solos, com caráter esquelético, foram estudados perfis de Plintossolos Pétricos e Cambissolos Háplicos no leste de Goiás, comparando-os, também, com outros perfis semelhantes descritos na literatura. Cada perfil de solo (seis ao todo) correspondeu a uma trincheira, que permitiu a descrição morfológica e as amostragens, realizadas em duas profundidades, totalizando 12 amostras. Os corpos de petroplintita das frações mais grosseiras da terra fina contribuem para aumentar o Fe2O3 do ataque sulfúrico dos Plintossolos. As relações Feo/Fed são, de forma generalizada, muito baixas, refletindo a elevada estabilidade das formas cristalinas de Fe. Os Plintossolos e os Cambissolos estudados apresentam valores médios de Ki e Kr relativamente baixos quando comparados com outros solos das mesmas classes e com caráter esquelético do bioma Cerrado. A ausência de hematita na fração argila dos solos estudados reflete um processo de xantização do pedoambiente mais úmido das bordas da chapada, local de ocorrência dos Plintossolos, cujo material erodido contribui para formação dos Cambissolos. A hematita só aparece na fração areia dos Plintossolos, associada aos corpos de petroplintita. Magnetita/maghemita foram identificadas nas duas classes de solos. Nos Cambissolos, a detecção de mica por difração de raios X da fração areia e de minerais com cores de interferência fortes nas lâminas delgadas, além dos maiores valores das relações Ki e Kr, realçam a presença de material menos intemperizado, relativamente aos Plintossolos. A pequena quantidade de plasma, 10 % em relação à área das lâminas delgadas, confirma o caráter esquelético dos solos estudados. Os Plintossolos apresentam estrutura granular adensada. Os Cambissolos apresentam o espaço poroso menos conectado e dominado por alvéolos e canais, com microestrutura de grãos com películas. 650 $aMineralogia 650 $aOxido de Ferro 650 $aSolo 653 $aÓxidos de ferro 653 $aPetroplintia 653 $aPetroplintita 653 $aSolos concrecionários 653 $aXantização 700 1 $aCURI, N. 700 1 $aSCHULZE, D. G. 700 1 $aMARQUES, J. J. G. de S. e M. 700 1 $aKER, J. C. 700 1 $aMOTTA, P. E. F. da 773 $tRevista Brasileira de Ciência do Solo, Viçosa, MG$gv. 31, n. 5, p. 875-886, set./out. 2007.
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